Nextflow

Nextflow, veri akışı programlama modeline dayanan ölçeklenebilir ve taşınabilir iş akışları oluşturma sistemidir. Yerel makine, HPC zamanlayıcıları, bulut platformları ve Kubernetes üzerinde çalıştırılabilir. Conda, Docker ve Singularity gibi çeşitli araçlarla yazılım bağımlılıklarını yönetmeyi destekler.

NE

nextflow-io · Bilimsel Araştırma & Hesaplama

YILDIZ3.5K
ÇATAL819
COMMIT—
KATKICI238
SÜRÜMv26.07.0-edge
GÜNCELLEMEbugün
İş AkışıBiyoinformatikBuluthpcApache-2.0
Ne yapar?
  • Veri akışı modeliyle paralel ve dağıtık işlem hatları tasarlarsın
  • İş akışlarını yerel makine, HPC, bulut servisleri veya Kubernetes üzerinde çalıştırırsın
  • Conda, Docker veya Singularity ile yazılım bağımlılıklarını yönetirsin
Kullanıcı yorumları
  • ↑ OlumluHacker News

    Sonraki akış: Veriye Dayalı Hesaplamalı Boru Hatları

    “Hemen hemen herkes iş akışı zamanlama karmaşıklığını hafife alır. Bu, araçların%99'unun, birçok kullanım vakası için geçerli olmayan çeşitli rastgele sınırlamalara ve tuhaflıklara sahip olduğu anlamına gelir. Bu, bu araçları kullanan insanların çoğunlukla fark etmediği bir şeydir (ve ...”

  • ↑ OlumluHacker News

    Sonraki akış: Veriye Dayalı Hesaplamalı Boru Hatları

    “Biyoinformatik boru hatları için Nextflow'u kullanmayı düşündüm, ancak henüz suya dalmadım. İşyerinde, bazı harici araçlara seslenmek için alt işlem kullanan huey1 görevlerinden (Python kütüphanesi; Celery'ye basit bir alternatif) oluşan bir proteomik boru hattı geliştiriyorum veya...”

Web Sitesi GitHub

Notum

Aynı kategoride: Bilimsel Araştırma & Hesaplama